Geautomatiseerde gegevensbevraging en -ontginning in bio-informatica

Dankzij de voortdurende ontwikkeling van gesofiticeerde methoden zijn wetenschappers in nstaat om steeds meer informatie te verzamelen over het leven dat ons omringt. Zo komen biologen voortdurend meer te weten over het menselijke genoom, en worden tegelijkertijd ook andere organismen in detail bestudeerd. In de onderzoekswereld bestaat een grote motivatie om nieuwe kennis beschikbaar te maken aan de hele gemeenschap, zodat erkenning verkregen kan worden voor de geleverde prestaties en zodat de grenzen van de menselijke kennis steeds verder gelegd kunnen worden. Wegens de grote hoeveelheid beschikbare data en de complexiteit ervan, is het nodig om op een automatische manier de nodige informatie te bundelen in een overzichtelijke samenvatting. Deze samenvattingen kunnen dan door de wetenschappers gebruikt worden om zich snel een beeld te vormen van de genen waar zij in geïnteresseerd zijn en van hun onderlinge relaties. In deze thesis wordt het beschreven probleem in twee belangrijke delen ontleed. Ten eerste moeten er betrouwbare methoden ontwikkeld worden die uit de literatuur nieuwe informatie kunnen extraheren (text mining). Deze methoden moeten geautomatiseerd zijn en hun output overzichtelijk gestructureerd, zodat de wetenschapper op een transparante manier toegang kan krijgen tot de gewenste data.