Onderzoek naar polyhydroxybutyraatproductie bij Cupriavidus metallidurans CH34 in gesimuleerde micrograviteit

In dit eindproject werd er onderzoek gedaan naar het polyhydroxybutyraatmetabolisme bij het modelorganisme Cupriavidus metallidurans. Polyhydroxybutyraat (PHB), behorende tot de groep van de polyesters, wordt door vele Gram-positieve –en negatieve bacteriën geproduceerd voor de opslag van koolstof en energie. Het effect van gesimuleerde micrograviteit op de groei en het PHB-metabolisme van het modelorganisme werd in drie testcondities onderzocht: gesimuleerde micrograviteit, de RWV in controlepositie (1xg) en de RWV in gesimuleerde micrograviteit met hoge wrijvingsstress. Er werd gezocht naar mogelijke wijzingen op transcriptieniveau tussen de drie groeicondities door het opzetten van een full-genome micro arrayexperiment. In parallel werden het volledig PHB-metabolisme voor het modelorganisme in kaart gebracht. Voor alle betrokken genen werden primers ontwikkeld en getest voor het uitvoeren van een kwantitatieve PCR. Ten slotte werd getracht een spectrofotometrische methode op punt te stellen voor het bepalen van de PHB-productie. Uit de vergelijkende analyse van de micro array werd er tussen de groeicondities geen significante verschillen gevonden in de genexpressie van het PHB-metabolisme. Toch zijn er specifieke primers ontwikkeld, waarmee in verder onderzoek de bevindingen bevestigd kunnen worden met behulp van kwantitatieve PCR. Er zijn twee spectrofotometrische methodes uitgetest, maar deze methodes dienen verder onderzocht te worden voor betrouwbaar gebruik.